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2004-7-29 为了进一步提高手机的操作效率，摩托罗拉在E398上增加了本系列少有的五方向导航键，在测试过程中，导航键的使用却未如理想，只要表现在手感略显生涩，尤其在进行向下操作确定选择时比较费力，幸好金属材料制造的导航键质量十分过硬，即使长期使用也不会出现松脱的现象。
E398的各功能键排布得传统而合理，左右功能键，菜单快捷键等按键整齐划一地排列在数字键的上方，数字键区域则采用了波浪式的设计，金属质感的数字键按感很好，弹性十足，大小恰到好处的面积也使操作更加便利。舍弃了过分抢眼的亮银色键盘背景灯，E398采用了更为柔和的淡白色背光灯，即使在黑夜中使用也不会显得刺眼，显示的习惯也十分清晰。一如机身正面的简约设计风格，E398的背部设计也同样简洁明快，不显丝毫的累赘，摄像头，自拍镜，闪光灯处于同一直线上，冲破了背部一统天下的黑色基调的束缚，显得更加的出众。背部的磨沙材料表现更为突出，微小而细腻的磨沙质感在背部表露无遗。
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菜单方面，E398默认的是九宫格式的菜单显示模式，只需要通过导航键的控制，用户可以方便的使用到自己所需要的功能，每个菜单图标的显示都相当的清晰明了。丰富多彩的屏幕待机画面设定也是E398的长处之一，机身内置的多幅待机画面效果已经是相当的不俗，加上E398支持网络下载图片，用户就可以随心所欲地个性化手机的屏幕了。如果一定要鸡蛋中挑骨头，挑剔地提出E398屏幕上的缺陷的话，或许可以说屏幕的面积略嫌偏小了一点。
