系统方面，由于电信版iPhone4S上市之际，苹果官方已经发布全新的iOS 5.1系统，因此搭此顺风，电信版iPhone4S采用的也是全新的iOS 5.1系统，而无需用户自行升级。相比联通版搭载的iOS5.0系统，新的iOS5.1系统加入9项升级，其中反应到系统界面上最主观的区别就是，电信版iPhone4S在锁屏界面永久性加入拍照快捷键，点击拍照键然后向上滑动即可打开相机功能。
当然，目前联通版iPhone4S也已经支持OTA升级，可以升级到最新的iOS5.1系统。除了系统本身带来的区别以外，电信版iPhone4S本身也与其他版本iPhone4S存在诸多区别。
首先，开机后电信版iPhone4S首先会自动播放一段iOS5.1系统特色功能的介绍视频。除了开机阶段，在手机屏幕被长时间点亮不用进入待机状态下，电信版iPhone4S也会自动播放这段演示视频。这项全新功能预计可能仅出现在测试版手机中，正式版将无此项功能。
其次，电信版iPhone4S内置了多种APP应用，包括Angry Birds、Fruit Ninja等十余项。这在以往非常少见，因为按照惯例，苹果所有版本iPhone手机一律不预装任何软件和应用，不过可能是由于我们拿到的是测试机的缘故，正式零售版可能不会预装程序。
再者，电信版iPhone4S在Safari浏览器中添加了中国电信的“互联星空”与“中国电信掌上营业厅”网络书签。不过这方面的变化对很多消费者来说无关紧要。
此外，电信iPhone4S的“设置”选项中的“关于本机”中，增加了一个MEID码。MEID是分配给CDMA制式的手机的56bit移动终端标识号，具备全球唯一性。标识号需被烧入终端，并且不能被修改，可用来对移动式设备进行身份识别和跟踪。在iPhone4时代，CDMA制式版本需要用户自行烧号后才能使用，而此次电信版iPhone4S已经被官方烧号处理过，不再需要用户自己处理，这点非常值得肯定。
还有一点细节，通过OTA推送升级到iOS5.1系统的iPhone4S都有一个小Bug，就是在下拉通知菜单中的天气提醒功能上，同时按住任意两天的天气信息，手机便会重新启动。但通过测试，这一Bug在电信版iPhone4S中并不存在，可算是一大欣慰之处。
