摩托罗拉XT390使用了时下流行的Android2.3操作系统。这一版本在稳定性和兼容性上都极为出色，并且具有多于10万个的海量应用程序可供用户使用。摩托罗拉XT390对于系统进行了二次开发，使用了最新版本的MotoSwitch个性化界面。该机的解锁界面非常有特点。解锁图标被信息、通话、拍照和情景模式等四个常见的功能图标所包围。用户点击解锁图标并将其拖动出圆圈即可解锁。若需要快速开启其他功能，则将其图标拖动到圆圈中央即可。
摩托罗拉XT390采用了“七分屏”，最多可增加至9个分屏。屏幕底座设置了四个快捷图标，除最右侧的Home键不可替换外，其余三个都可替换成其他快捷图标。
MotoSwitch界面保持了Andorid系统应用使用最频繁的下拉菜单功能。该下拉菜单分为三部分：上部为近期任务;中部为正在进行的任务;下部为通知。能够清楚表明手机所处的状态以及需要处理的事情。同时，该界面也支持常见的插件添加功能。对于使用过Android手机的朋友来说，这一功能相信已经十分熟悉。
摩托罗拉XT390的菜单界面采用4行×4列的格式排列。整体显得十分的整洁，美观。并可根据不同类别进行分类显示。当然用户可以随意新建群组，进行个性化分类，方便用户查找和使用应用程序。
