Android 4.0系统新的后台管理系统依旧在vivo S6中得以保留，按动两下Home键调出后台管理器，通过滑动滑块式的程序卡片来关闭应用程序。而下拉通知栏则是加入了多个快捷电源开关，方便日常使用。
后台管理系统
在Android 4.0系统中新添加的流量限制和开发人员选项经过了vivo的重新设计，精简了一些我们基本不会用到的选项，更加实用。
流量监控及开发人员选项
在系统升级方面，vivo S6内置了系统升级程序，系统会自动检测最新版的升级，并且进行提醒。
系统升级
备份功能已经是智能手机必备的功能之一，虽然现在也有很多第三方软件能够实现该功能，不过vivo S6还是自带了一个同步助手软件，能够对联系人和短信进行备份。另外，vivo S6带有的文档管理软件也改进了许多，新的文档管理更加易读，使用起来较之前的更加方便。
同步助手和文档管理
程序管理中集成了系统优化、安装卸载现有程序两大功能，它可以一键清理正在运行的程序，释放出更多的运行内存。
程序管理
