系统方面，联想S90自然还是搭载的自家VIBE UI系统，不过在版本号上采用的是2.0版本。首先最大的改变就是在功能上相比之前的版本更加的人性化，更利于用户的一系列操作。锁屏界面下，VIBE UI 2.0支持横滑直接更换待机桌面，非常方便。而在控制方面，支持手势控制整理桌面图标和黑屏解锁、黑屏手势操控，可玩性大大提升。
在系统设计上，该系统采用了全新的扁平化设计，时尚简约的风格也更加讨喜。在界面层级之上，联想VIBE UI 2.0采用的是更加直观的单级菜单，所有应用程序都在一级分页之中，用户不需要进入二级菜单进行操作，操作效率的提升不言而喻。
在界面管理方面，联想VIBE UI 2.0也是十分轻松便捷。向上滑动可以直接关闭后台应用程序，一键清除则是在所有应用卡片下方向上滑动来完成。长按主屏幕空白处可以进行小插件功能添加，这里有不少的实用插件可以进行选择。当然，点击菜单键则是安卓系统独有的设置功能，可以更换主题、壁纸，进行屏幕内容管理。
说完了常规的操作方面，这款联想S90在小功能方面也是颇有亮点。首先其添加了改进的系统日历功能，用户可以再日历上完成日常备忘、生日提醒、天气查看等诸多功能。此外，该机还随机安装有一些常备好用的应用程序，如乐安全、茄子快传、手机淘宝、美咖相机，用户开机就可使用手机，没有丝毫上手障碍。官方介绍，VIBE UI 2.0将会每两周迭代一次，这对于系统的完善也是颇有帮助。
小结：联想VIBE UI 2.0操作更加简便，黑屏手势下控制也颇有可玩性。
