系统方面，vivo X9s搭载了基于Android 7.1的Funtouch OS 3.1。外观和操作逻辑方面没有大的变化，但是从X9的Android 6.0升级到Android 7.1，在系统流畅性方面会有所提升。
来一组外观对比，外观方面，Funtouch OS 3.1活泼、多彩的配色、统一的圆角矩形图标都给人不错的印象。
从底部向上滑的控制中心也是Funtouch OS一直所采用的，目前大多数手机也开始采用这一设计，方便单手操作，并且支持自定义，小编建议可以将一些“相机”“移动网络/WLAN”“微信扫一扫”等常用功能放在第一屏，习惯后会非常节省时间。
此次vivo X9s系列新增了息屏显示功能。此前，vivo Xplay6已经搭载了这一功能。
Funtouch OS 3.1依然支持受好评的分屏多任务，在看视频、看电子书抑或购物时，来消息直接会在右上角显示，点开即可实现分屏，在查看消息的同时不耽误手头的事情。
Funtouch OS 3.1支持微信、QQ分身，对于有两个账号的用户来说还是非常方便的。
